Su carrera profesional siempre ha girado alrededor de los derechos de los pueblos indígenas llegando a ser Experto Independiente y Presidente del Foro Permanente sobre Cuestiones Indígenas de Naciones Unidas (2011-2016). Durante este periodo en Naciones Unidas, Álvaro fue responsable de la primera Evaluación mundial del cumplimiento de la Declaración de los Derechos de los Pueblos Indígenas de Naciones Unidas en Guatemala (2012). A lo largo de su carrera profesional, el activista Maya, ha elaborado diferentes informes sobre la realidad indígena. Los más destacados son: el Informe sobre la realidad de la Infancia Indígena en Mesoamérica (México, Guatemala, Honduras y Nicaragua); el Informe del estudio sobre la democracia y los pueblos indígenas en América Latina (México, Guatemala y Ecuador); y el Informe sobre Comisiones de Verdad y Pueblos Indígenas en América (Guatemala, Perú y Canadá).

Para la Corte Suprema de Justicia de Guatemala, Álvaro Esteban Pop Ac elaboró la Propuesta de Política Institucional para la Pertinencia Cultural 2014. Y el mismo año, para la Organización de Estados Americanos (OEA), realizó el estudio sobre Pueblos Indígenas en la Observación Electoral en América Latina. Entre los cargos que ocupó se encuentran el de miembro de la instancia de diálogo global con pueblos indígenas de la Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO); Presidente del Organismo Indígena Naleb’; Jefe de la Misión Indígena de Observación Electoral en Guatemala los años 1999, 2003, 2007 y 2011; Observador electoral de la OEA Ecuador; Vice-presidente de la Fundación Soros en Guatemala; y Presidente de Save the Children en Guatemala, entre otros. Además, participó en el proceso preparativo de los Acuerdos de Paz en Guatemala y el Pacto Fiscal; y ha contribuido como analista de la reforma constitucional de Bolivia.